Ислам на территории нынешнего Кыргызстана проник достаточно давно. Уже в X в значительная часть аристократии на данной территории исповедовала Ислам. Вторая волна активного распространения Исламского вероучения возникла благодаря странствующим муллам в XIX в, которые обучали религии большое количество сыновей и дочерей киргизов.

В настоящее время в киргизском государстве находятся около 60 медресе и исламских центров. Очень основательно подготовка мусульманских теологов ведется в ошском государственном университете.

Доля мусуьман в настоящий момент стремительно увеличивается в Киргизии, особенно этот рост заметен в Бишкеке и Чуйской области. Основные национальности, исповедующие Ислам в этом регионе это киргизы, узбеки, дунгане, уйгуры, таджики и другие народы.